خب شما میتونید کدهای css و js مربوطه رو به صورت فایل های مجزایی ذخیره و آپلود کنید به یه مسیر خاصی در سایت تون.
بعد اون فایل ها رو در header.php فراخوانی کنید مثل:
<link rel='stylesheet' href='مسیر آپلود فایل css'>
<script type='text/javascript' src='مسیر آپلود فایل js'></script>
به این ترتیب استایل و اکشن تعریف میشه.
بعد باید از کلاس های موجود در بخش html نمونه کد، برای تغییر ظاهر هدرتون استفاده کنید که اونم مستلزم تغییرات در header.php هست.